بررسی تفاوت‌های ژنتیکی پاتوتایپ‌های زنگ قهوه‌ای گندم ایران بر اساس تعیین توالی ناحیه ITS1

نویسندگان

  • شهاب حاج منصور دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات تهران، گروه بیماری‌شناسی گیاهی
  • علیرضا نیازمند دانشگاه آزاد اسلامی، واحد جهرم، گروه بیماری‌شناسی گیاهی
چکیده مقاله:

سابقه و هدف: بیماری زنگ قهوه‌ای (زنگ برگی) گندم یکی از بیماری‌های مهم گندم است که توسط قارچ Puccinia triticina Erikson ایجاد می‌شود. در سال‌های اخیر توالی‌یابی نواحی مختلف DNA ریبوزومی به ویژه ناحیه ITS1 به منظور بررسی تفاوت‌های ژنتیکی پاتوتایپ‌های عوامل بیماریزای زنگ‌های مختلف گندم مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از انجام این پژوهش، بررسی تشابهات و تفاوت‌های موجود بین پاتوتایپ‌های عوامل بیماریزای زنگ قهوه‌ای گندم در مناطق مختلف جغرافیا‌یی ایران بر اساس توالی‌یابی ناحیه ITS1 از DNA ریبوزومی بود.       مواد و روش‌ها: در ابتدا DNA یوریدینیوسپورهای پاتوتایپ‌های عامل بیماری زنگ قهوه‌ای گندم استخراج گردید. سپس از تکنیک PCR و پرایمرهای ITS5و Rust2 به منظور تکثیر ناحیه ITS1 استفاده شد. محصولات PCR تعیین توالی شدند و شماره دسترسی آنها در بانک ژن ثبت گردید. با استفاده از نرم‌افزار‌های MEGA4 و DNA MAN هم ترازی توالی‌ها و مقایسه توالی‌های تکرار شونده در طول ناحیه ITS1 انجام گرفت.      یافته‌ها: بررسی توالی‌های ITS1 تکثیر شده جدایه‌ها نشان دهنده تفاوت 2/1-0 درصدی بین آنها بود. این تفاوت‌ها شامل نواحی جهش یافته، حذف و اضافه شده و نیز اندازه متفاوت ناحیه تکثیر شده در بین توالی‌های مورد بررسی بود. همچنین مشخص گردید که ناحیه ITS1 زنگ قهوه‌ای گندم از تعدادی نواحی تکرار شونده بازی تشکیل شده است. این نواحی از نظر تعداد واحد‌های تکرار شونده و همچنین ترتیب باز‌ها در بین جدایه‌های مختلف متفاوت گزارش شدند.      نتیجه‌گیری: در مطالعه حاضر با وجود تفاوت در طیف بیماریزایی و جغرافیایی جدایه‌های مورد بررسی، توالی‌های مربوط به ناحیه ITS1 دارای تفاوت‌ اندکی با یکدیگر بودند. از آنجایی که هیچ‌گونه ارتباط منطقی بین تفاوت‌های موجود در ناحیه‌ITS1 جدایه‌ها و تفاوت میان پاتوتایپ و فنوتیپ جدایه‌ها ‌مشاهده نشد، بنابراین توالی‌یابی این ناحیه از DNA ریبوزومی نمی‌تواند به عنوان یک مارکر جهت تشخیص پاتوتایپ‌های قارچ عامل بیماری زنگ قهوه‌ای گندم مورد استفاده قرار گیرد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

بررسی تفاوت های ژنتیکی پاتوتایپ های زنگ قهوه ای گندم ایران بر اساس تعیین توالی ناحیه its1

سابقه و هدف: بیماری زنگ قهوه ای (زنگ برگی) گندم یکی از بیماری های مهم گندم است که توسط قارچ puccinia triticina erikson ایجاد می شود. در سال های اخیر توالی یابی نواحی مختلف dna ریبوزومی به ویژه ناحیه its1 به منظور بررسی تفاوت های ژنتیکی پاتوتایپ های عوامل بیماریزای زنگ های مختلف گندم مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از انجام این پژوهش، بررسی تشابهات و تفاوت های موجود بین پاتوتایپ های عوامل بیمار...

متن کامل

بررسی تفاوت های ژنتیکی پاتوتایپ های زنگ قهوه ای گندم ایران بر اساس تعیین توالی ناحیه its۱

سابقه و هدف: بیماری زنگ قهوه ای (زنگ برگی) گندم یکی از بیماری های مهم گندم است که توسط قارچ puccinia triticina erikson ایجاد می شود. در سال های اخیر توالی یابی نواحی مختلف dna ریبوزومی به ویژه ناحیه its1 به منظور بررسی تفاوت های ژنتیکی پاتوتایپ های عوامل بیماریزای زنگ های مختلف گندم مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از انجام این پژوهش، بررسی تشابهات و تفاوت های موجود بین پاتوتایپ های عوامل بیمار...

متن کامل

مطالعه تنوع ژنتیکی پاتوتیپ‌های Puccinia triticina عامل زنگ قهوه‌ای گندم ایران بر اساس توالی یابی ناحیه rDNA IGS1

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌های ایرانی قارچ Puccinia triticina، یازده جدایه متعلق به مناطق جغرافیایی مختلف تعیین فنوتیپی و پاتوتیپی گردیدند و ناحیه IGS1rDNA توالی‌یابی شد. در رابطه با کلیه جدایه‌ها یک محصول PCR با اندازه 870 جفت بازی به دست آمد. هم‌ردیف‌سازیتوالی‌های IGS1 مربوط به جدایه‌های مورد بررسی نمایانگر 2/1-0 درصد تفاوت بین آنها بود که بیانگر توالی‌های بسیار مشابه در این نا...

متن کامل

مطالعه تنوع ژنتیکی پاتوتیپ های puccinia triticina عامل زنگ قهوه ای گندم ایران بر اساس توالی یابی ناحیه rdna igs1

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های ایرانی قارچ puccinia triticina، یازده جدایه متعلق به مناطق جغرافیایی مختلف تعیین فنوتیپی و پاتوتیپی گردیدند و ناحیه igs1rdna توالی یابی شد. در رابطه با کلیه جدایه ها یک محصول pcr با اندازه 870 جفت بازی به دست آمد. هم ردیف­سازیتوالی های igs1 مربوط به جدایه های مورد بررسی نمایانگر 2/1-0 درصد تفاوت بین آنها بود که بیانگر توالی های بسیار مشابه در این ناحیه است. ...

متن کامل

مطالعه تنوع ژنتیکی پاتوتیپ های puccinia triticina عامل زنگ قهوه ای گندم ایران بر اساس توالی یابی ناحیه rdna igs۱

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های ایرانی قارچ puccinia triticina، یازده جدایه متعلق به مناطق جغرافیایی مختلف تعیین فنوتیپی و پاتوتیپی گردیدند و ناحیه igs1rdna توالی یابی شد. در رابطه با کلیه جدایه ها یک محصول pcr با اندازه 870 جفت بازی به دست آمد. هم ردیف سازیتوالی های igs1 مربوط به جدایه های مورد بررسی نمایانگر 2/1-0 درصد تفاوت بین آنها بود که بیانگر توالی های بسیار مشابه در این ناحیه است. ...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 3  شماره شماره 3 (پیاپی 8)

صفحات  194- 202

تاریخ انتشار 2010-10-01

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023